La primera vez del Celeste en la segunda categoría del fútbol argentino fue en condición de local ante Temperley, en el comienzo de la temporada 2019-20. El equipo, dirigido por Marcelo Vázquez, venció 3-0 con un gol de Nicolás Foglia y un doblete de Bruno Sepúlveda.

En la apertura del campeonato del 2021, el León lo ganaba con un tanto de Víctor Beraldi cuando, en los últimos instantes del partido, Deportivo Maipú estableció el 1-1. Resultado que se repitió al año siguiente, pero en esta ocasión ante Instituto. Luis Silba fue el autor del gol de Estudiantes.

La primera y única derrota llegó en 2023, cuando el elenco riocuartense cayó por la mínima ante San Martín de Tucumán. La segunda victoria, conseguida el año pasado, gracias al tanto de Guillermo Villalba ante Deportivo Madryn.

La temporada 2025 en la Primera Nacional para el conjunto de Iván Delfino iniciará con la visita a Gimnasia en Mendoza el sábado 8 de febrero a las 20:30. Será el primer debut del Celeste en condición de visitante desde que está en Segunda División.